Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 L -4 -4 -6 -6 -4 -4 -5 -6 -5 3 5 -5 5 -2 -5 -5 -3 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 71 0 15 0 0 0 0 0 0 0 1.19 0.41 2 L -1 -3 -2 -4 -3 -1 -3 -1 -4 2 2 -3 0 -2 -4 -1 2 -4 -3 3 3 0 2 0 0 2 0 5 0 9 25 0 1 0 0 5 18 0 0 30 0.38 0.24 3 S -1 -4 -1 -4 -5 2 -2 -2 3 -6 -6 0 -5 -4 -5 6 1 -5 2 -5 4 0 1 0 0 10 1 3 7 0 0 5 0 0 0 55 7 0 8 0 0.99 0.59 4 S -1 2 3 5 -5 -3 -1 -2 -1 -2 -3 -2 -4 -3 -4 0 1 -6 -3 -1 5 10 14 38 0 0 1 2 1 2 3 2 0 1 0 8 8 0 1 4 0.63 0.39 5 S 1 -6 -6 -7 -3 -6 -6 -6 -7 -5 -5 -6 -3 2 -5 2 3 11 -1 -3 10 0 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 1 7 0 16 16 44 1 2 1.97 0.89 6 L -3 -6 -7 -5 -4 -2 -7 -4 -2 -1 5 -6 -2 5 -7 -5 -5 -1 3 -3 3 0 0 1 0 2 0 2 1 2 56 0 0 22 0 0 0 1 10 0 1.28 0.65 7 W -4 -8 -8 -9 -8 -6 -8 -7 -7 -7 -3 -8 0 2 -9 -1 -2 12 1 -5 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 2 8 0 6 3 69 4 1 3.34 1.28 8 V 4 -5 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -6 3 2 -5 -2 1 -5 -2 0 -3 -2 3 32 0 0 0 0 0 0 0 0 15 18 0 0 6 0 3 5 0 1 21 0.70 0.46 9 N 1 -5 0 -4 -1 -5 -4 3 -5 1 -2 -5 -2 -3 -5 -3 0 -2 1 5 10 0 4 0 1 0 1 25 0 7 3 0 1 1 0 1 5 1 4 35 0.65 0.44 10 V 0 -6 -6 -6 4 -6 -6 -5 -5 2 -2 -6 -1 6 -6 -1 3 -3 1 1 7 0 0 0 9 0 0 1 0 11 3 0 2 36 0 4 16 0 4 8 1.00 0.55 11 A 5 -5 -4 -5 1 -5 -5 0 -5 1 -1 -5 1 -2 -5 2 -2 -6 -3 2 41 0 0 0 3 0 0 6 0 8 7 0 4 2 0 14 2 0 1 14 0.68 0.48 12 L 1 -5 -5 -6 0 -5 -5 1 -5 4 2 -5 3 1 -5 -1 -1 -5 -3 3 11 0 0 0 2 0 0 10 0 20 18 0 6 5 0 4 4 0 1 20 0.52 0.36 13 A 2 -7 -4 -6 -2 -3 -5 -6 -3 -2 -1 -7 9 5 -7 -4 -5 -6 1 -4 15 0 1 0 1 1 1 0 1 2 4 0 50 19 0 2 1 0 4 1 1.86 0.92 14 G 3 -5 -4 -4 -1 -4 -5 3 -2 0 2 -5 2 1 -5 -1 0 -5 -3 0 21 0 0 1 1 0 0 23 1 4 22 0 5 5 0 3 6 0 1 6 0.48 0.35 15 I 2 -6 -6 -6 0 -5 -6 -3 -6 2 3 -6 2 3 -6 -3 -2 -5 -4 2 20 0 0 0 2 0 0 2 0 12 30 0 5 11 0 1 2 0 0 16 0.72 0.45 16 A 4 -6 -3 -5 2 -3 -5 3 -4 -3 -3 -5 -3 0 -5 3 0 -6 -3 -1 31 0 1 0 5 1 0 18 0 1 2 0 1 5 0 25 6 0 1 4 0.74 0.52 17 I 3 -5 -4 -3 -2 -4 -5 -1 -2 0 0 -5 1 1 -5 2 4 -6 -3 -2 22 0 0 2 1 0 0 5 1 4 10 0 3 7 0 16 25 0 1 3 0.56 0.45 18 L -1 -6 -6 -7 -2 -6 -6 -3 -6 3 4 -6 0 1 -6 -1 0 -6 -4 2 6 0 0 0 1 0 0 2 0 18 41 0 1 6 0 4 7 0 0 13 0.80 0.47 19 V 2 -5 -4 -6 0 -5 -5 0 -2 2 0 -5 -2 3 -4 -2 -2 -2 3 4 15 0 1 0 2 0 0 7 1 10 10 0 1 11 1 3 2 1 11 25 0.53 0.38 20 F -4 -6 -8 -6 -2 -6 -8 -8 -3 2 0 -8 0 8 -6 -7 -2 -1 2 0 2 0 0 1 1 0 0 0 1 9 9 0 2 60 0 0 3 1 6 5 1.82 0.84 21 V 0 -6 -4 -6 -2 -4 -6 -2 -5 3 2 -5 1 5 -4 -3 -1 4 3 1 9 0 1 0 1 1 0 3 0 13 20 0 4 20 1 1 3 4 9 9 0.62 0.39 22 Y 1 -5 -5 -5 -2 -3 -4 0 -4 1 2 -5 -1 4 -4 -1 -2 3 3 1 14 0 0 0 1 1 1 8 0 6 16 0 1 18 1 5 2 4 10 11 0.47 0.34 23 M -1 -1 -4 -4 -3 0 -2 -2 -2 1 4 -1 4 0 -4 -2 0 5 -3 0 6 4 1 1 0 4 2 3 1 6 34 3 11 3 1 4 5 7 1 5 0.45 0.33 24 G 2 -1 -2 -3 -1 -1 1 2 -3 -3 -2 -2 0 -1 -3 3 1 -2 -3 -3 14 3 1 1 1 2 10 15 1 1 4 2 3 3 1 26 8 0 1 1 0.35 0.33 25 R 0 4 -3 -4 -4 -2 -3 -4 0 -1 0 0 2 3 -4 0 -2 5 2 -1 8 20 1 1 0 2 1 1 2 3 10 4 5 14 1 8 3 8 6 3 0.44 0.33 26 T -1 3 3 0 -2 1 -1 0 -1 -3 -3 2 -2 -2 -3 1 1 -5 -2 -1 4 17 13 5 1 5 3 7 2 1 2 12 1 2 1 10 11 0 1 5 0.28 0.24 27 I 1 1 0 -2 -3 0 -2 -2 -2 0 0 0 0 1 1 0 -1 -1 -1 2 11 9 5 2 0 5 2 2 1 4 10 5 2 6 6 8 3 1 1 19 0.10 0.14 28 R 0 3 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -1 2 -2 -1 -2 0 1 -1 -2 2 8 17 1 2 1 3 5 4 3 2 4 13 0 3 1 7 9 1 1 15 0.19 0.20 29 P 1 -1 0 2 -1 -2 -1 -2 -1 -4 -3 -1 -3 -5 5 1 -1 -5 -4 -2 9 3 5 13 2 1 4 3 1 1 3 4 0 0 32 12 3 0 1 3 0.63 0.40 30 G 0 2 -2 -1 -4 0 0 2 -2 -2 -2 1 -2 -3 3 0 -2 -2 -3 -1 9 12 2 3 0 4 6 16 1 3 4 9 1 1 16 6 2 0 1 6 0.26 0.22 31 R -1 3 1 -2 -5 1 2 0 0 -4 -2 3 -3 -4 -3 0 0 -1 -1 -1 5 16 5 1 0 7 12 8 2 1 5 18 0 0 1 8 5 1 2 4 0.29 0.26 32 P -1 0 -2 0 -5 0 0 -3 2 -3 -3 3 -1 -2 0 -1 -1 7 4 -2 5 6 2 6 0 5 5 2 5 2 2 18 1 1 4 4 4 13 13 3 0.49 0.35 33 R -4 7 -2 -4 -7 1 -1 -4 1 -6 -5 3 -3 -6 -4 -3 -4 -4 -6 -6 1 59 2 1 0 6 3 1 3 0 1 16 1 0 1 2 1 0 0 0 1.55 0.79 34 L -1 -1 -2 -3 -2 -2 -1 -2 -2 2 2 -1 1 -1 -2 -1 3 -4 0 1 5 2 1 1 0 2 4 2 1 10 24 3 3 2 1 3 18 0 3 12 0.23 0.22 35 I 1 -3 -4 -5 -2 -3 -2 -4 -1 0 1 -4 -1 6 -4 1 -1 -2 2 -1 10 1 1 0 1 1 3 1 1 6 12 1 1 33 1 13 4 0 7 4 0.62 0.41 36 W -2 -2 -2 -5 -5 -4 -4 -4 7 -1 1 -4 2 1 -3 -2 -3 1 6 0 3 2 2 0 0 0 1 1 26 4 13 1 6 5 2 3 2 2 22 6 0.93 0.52 37 G 0 -3 -2 -5 -4 -1 -4 -3 1 1 0 -4 0 0 -5 -2 2 0 5 2 8 1 2 0 0 3 1 2 3 8 10 0 2 3 0 3 16 1 21 16 0.46 0.35 38 A 1 -4 -4 -5 1 -5 -5 -4 -4 4 3 -5 0 -2 -4 -3 0 -3 -3 3 10 0 1 1 3 0 0 1 0 24 29 0 2 1 1 2 5 0 0 18 0.63 0.38 39 T 2 -4 -1 -4 -3 -3 -4 -2 -1 -2 0 -4 -2 1 1 3 4 -2 -2 0 18 0 3 0 0 0 0 3 2 2 8 0 1 5 6 22 23 1 1 5 0.44 0.38 40 L 3 -4 -3 -4 -1 -3 -3 2 -4 2 0 -4 -1 2 -3 1 1 -2 -3 -1 24 0 1 0 1 1 1 16 0 13 10 0 2 8 1 8 10 0 0 4 0.35 0.30 41 M 0 -5 -5 -5 -2 -4 -3 -2 -5 2 4 -5 2 3 -4 -2 -2 -2 0 1 9 0 0 0 1 0 1 3 0 13 35 0 5 13 1 3 2 0 3 11 0.54 0.34 42 I -1 -6 -5 -6 -2 -5 -6 -5 -4 6 -1 -6 -1 -1 -2 -2 -1 -6 -4 5 5 0 0 0 1 1 0 1 0 39 3 0 1 2 2 4 4 0 1 37 1.16 0.60 43 P -1 -5 1 -5 5 -4 -5 -5 -1 -3 0 -4 2 -2 2 0 5 -6 -4 -1 6 0 6 0 10 0 0 0 1 1 11 1 5 1 11 7 34 0 0 4 0.69 0.49 44 L 1 -5 -4 -5 -1 -4 -5 1 -3 1 2 -3 1 4 -5 -1 1 -1 -2 0 13 0 0 0 1 0 0 13 1 8 22 1 3 16 0 3 11 1 1 6 0.40 0.31 45 V -3 -6 -6 -7 -5 -6 -5 -7 -6 6 -2 -6 -1 3 -6 -1 1 4 -3 4 2 0 0 0 0 0 1 0 0 41 2 0 1 10 0 5 7 4 0 25 1.16 0.60 46 S 6 -5 -4 -5 -3 -3 -2 0 -6 -6 -4 -5 1 -2 -4 3 -2 -7 -6 -3 55 0 1 0 0 1 3 6 0 0 2 0 4 2 0 22 2 0 0 1 1.15 0.68 47 I 4 -5 -5 -5 1 -5 -5 2 -5 0 -3 -5 -1 4 -5 1 1 0 -4 -2 35 0 0 0 3 0 0 12 0 5 2 0 2 17 0 9 10 1 0 3 0.68 0.47 48 S -2 -5 -5 -6 -1 -5 -4 -5 -5 4 2 -5 1 2 -6 -1 -1 1 4 3 4 0 0 0 1 0 1 1 0 22 19 0 3 7 0 5 4 2 12 19 0.62 0.38 49 S 3 -5 -3 -4 0 -2 -3 -3 7 -3 -2 -5 1 -2 -5 3 1 -6 -3 -2 25 0 1 1 2 1 2 1 25 2 4 0 3 2 0 21 7 0 1 3 0.88 0.57 50 Y -8 -8 -8 -4 -8 -7 -8 -4 -2 -7 -2 -8 -7 -1 -8 -8 -8 0 10 -7 0 0 0 1 0 0 0 2 1 0 5 0 0 1 0 0 0 1 86 0 3.31 1.41 51 L -3 -6 -4 -7 -4 -4 -5 -5 -2 -2 2 -6 2 7 -7 -4 -2 3 5 -2 2 0 1 0 0 1 1 1 1 2 21 0 4 40 0 1 3 3 15 3 1.32 0.69 52 G 3 2 -2 -5 -1 -1 -4 0 -4 -1 -2 -3 -3 -1 -5 2 2 -5 3 -3 28 12 2 0 1 2 0 7 0 4 3 1 1 3 0 14 10 0 11 2 0.49 0.41 53 L -5 -5 -4 -8 -7 0 -3 -8 -7 3 1 -7 10 -4 -7 -5 -4 -2 1 -3 1 1 1 0 0 4 2 0 0 12 11 0 57 1 0 1 1 1 5 1 2.13 1.05 54 L 5 -1 -3 -4 -1 -2 -4 0 -4 -2 -2 -3 -1 3 -4 -2 -2 3 -1 -1 46 3 1 1 1 2 1 6 0 3 4 2 2 12 1 3 3 4 2 5 0.70 0.45 55 S 0 -1 1 -1 -2 -2 -1 -3 -1 -3 0 -2 -1 1 -4 4 3 -2 -2 -3 7 3 5 4 1 2 4 2 1 1 9 2 1 5 1 31 17 1 1 2 0.43 0.36 56 G -2 -3 3 3 -5 -2 -2 5 0 -5 -4 -3 -2 -2 -4 1 -3 -2 -3 -5 4 2 15 14 0 2 2 36 2 1 2 2 1 2 1 11 2 1 1 1 0.75 0.45 57 L -2 -4 -3 -2 -4 0 -2 -2 2 0 3 -3 0 3 -4 -2 -1 6 1 0 3 1 1 3 0 5 2 4 5 4 29 1 2 10 1 3 4 11 5 6 0.48 0.31 58 T 0 -3 -1 -2 -5 -3 -1 6 -4 -4 -3 -3 -5 -3 -3 -1 1 1 -3 -3 9 2 3 3 0 1 4 50 0 1 3 2 0 1 1 4 9 2 1 2 0.88 0.51 59 V 1 -2 -1 -1 -4 -1 0 -3 0 1 -1 -2 0 0 -2 0 0 7 2 1 10 2 3 4 0 3 7 2 2 7 7 2 2 3 2 8 5 15 6 10 0.34 0.26 60 G 2 -2 0 -2 -2 -2 -1 0 -1 0 -2 -2 -2 -2 -3 2 3 1 0 0 17 2 4 2 1 2 3 7 1 4 4 2 1 2 1 14 21 2 3 6 0.27 0.26 61 M -1 -2 -1 -2 -1 -1 -1 -1 2 -1 -1 -2 -1 3 2 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